Разные подходы есть. У нас на одном из проектов для многозалежного объекта полностью разбуренные залежи моделируется одним танком, частично разбуренные - делятся на три танка: зона интенсивных отборов, зона умеренных отборов(единичные скважины/кусты) и зона ВНС. Параметры аквифира в зоне ВНС задаются по аналогии с первыми двумя, уже настроенными на факт. Тут важно отметить, что залежи эксплуатируются на естественном режиме.

Коллеги из ГПН в Тюмени, насколько мне известно,  под каждую скважину/ группу скважин ведут свой танк для краткосрочных расчетов. Это удобно для случая закачки рабочего агента и влияния этой закачки на обводнённость/ ГФ на конкретные скв.